{"id":92372,"date":"2025-04-02T11:28:37","date_gmt":"2025-04-02T10:28:37","guid":{"rendered":"https:\/\/helloproject.es\/vigilancia\/descubren-fallos-en-las-secuencias-geneticas-del-coronavirus-en-la-mayor-base-de-datos-mundial\/"},"modified":"2025-04-02T11:28:37","modified_gmt":"2025-04-02T10:28:37","slug":"descubren-fallos-en-las-secuencias-geneticas-del-coronavirus-en-la-mayor-base-de-datos-mundial","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/helloproject.es\/vigilancia\/descubren-fallos-en-las-secuencias-geneticas-del-coronavirus-en-la-mayor-base-de-datos-mundial\/","title":{"rendered":"Descubren fallos en las secuencias gen\u00e9ticas del coronavirus en la mayor base de datos mundial"},"content":{"rendered":"

El equipo multidisciplinar liderado por el Instituto de Biolog\u00eda Integrativa de Sistemas del CSIC y la Universitat de Val\u00e8ncia investigan una nueva hip\u00f3tesis sobre la capacidad del virus SARS-CoV-2 para mutar e infectar a seres humanos.<\/p>\n

Tras revisar la base de datos gen\u00e9ticos del virus m\u00e1s empleada en la pandemia, la GISAID, los cient\u00edficos encontraron\u00a0\u2018falsos positivos\u2019 en su capacidad de reparaci\u00f3n de las deleciones, un proceso que restaura partes del genoma del virus y que afecta a su capacidad para replicarse o evitar al sistema inmunol\u00f3gico.<\/p>\n

El trabajo, publicado en la revista\u00a0Virus Evolution, describe una hip\u00f3tesis sobre cambios gen\u00e9ticos raros en la prote\u00edna de la esp\u00edcula del SARS-CoV-2, empleada para infectar las c\u00e9lulas.<\/p>\n

En concreto, la investigaci\u00f3n se centr\u00f3 en los llamados eventos de reparaci\u00f3n de las deleciones en esta prote\u00edna, donde el virus parece corregir su genoma.<\/p>\n

Despu\u00e9s de realizar un minado de datos masivo en GISAID, descubrieron que varios de los hallazgos iniciales se debieron a errores de procesamiento de datos en las bases gen\u00e9ticas.<\/p>\n

Encontraron\u00a0\u2018falsos positivos\u2019\u00a0en la capacidad reparaci\u00f3n de las deleciones del SARS-CoV-2, un proceso que restaura partes del genoma del virus\u00a0<\/p>\n

Los m\u00e9todos inform\u00e1ticos empleados para analizar las secuencias virales indujeron equivocaciones y generaron la impresi\u00f3n de que el virus estaba reparando sus mutaciones con mayor regularidad.<\/p>\n

Al comparar estos datos con la informaci\u00f3n obtenida de la secuenciaci\u00f3n de genomas \u2014lecturas de secuenciaci\u00f3n\u2014, el equipo logr\u00f3 obtener una visi\u00f3n m\u00e1s realista de los cambios gen\u00e9ticos que sufre el virus.<\/p>\n

<\/a><\/p>\n

Menos del 60 % de eventos confirmados<\/h3>\n

\u201cUtilizando el repositorio de secuencias gen\u00e9ticas GISAID estimamos una frecuencia muy alta de estos eventos de reparaci\u00f3n de deleciones que se espera que sean raros\u201d, explica la investigadora del CSIC y l\u00edder del estudio, Mireia Coscoll\u00e1 Dev\u00eds.<\/p>\n

El equipo observ\u00f3 que las series de la base de datos estaban procesadas por cada laboratorio de forma diferente y que conten\u00edan muchos falsos positivos. Aunque en determinados casos pudieron confirmar que se trataba de un fen\u00f3meno real, la mayor\u00eda se deb\u00edan al procesamiento de las secuencias.<\/p>\n

La investigaci\u00f3n puso de relieve la importancia de examinar los datos gen\u00e9ticos con el objetivo de evitar conclusiones err\u00f3neas<\/p>\n

\u201cVimos que menos del 60 % de los eventos de reparaci\u00f3n de deleciones se pod\u00edan confirmar. Aunque no hemos podido cuantificarlo exactamente para todos, podemos comparar las proporciones del marcador en varias bases de datos, y vemos que la diferencia es de 5 a 51 veces menos frecuente de lo que aparec\u00eda en las bases de datos procesadas\u201d, calcula la investigadora del CSIC.<\/p>\n

Pese a que estos eventos de reparaci\u00f3n son poco comunes, el estudio evidenci\u00f3 que, cuando ocurren, pueden afectar de forma sutil al comportamiento del virus.<\/p>\n

\u201cPor ejemplo, ciertas reparaciones pueden modificar la forma en que el virus ingresa a las c\u00e9lulas o influye en la respuesta a los anticuerpos generados por la vacunaci\u00f3n\u201d, asegura Coscoll\u00e1, algo que el equipo de investigaci\u00f3n demostr\u00f3 mediante experimentos\u00a0in vitro.<\/p>\n

De esta forma, la investigaci\u00f3n puso de relieve la importancia de examinar los datos gen\u00e9ticos con el objetivo de evitar conclusiones err\u00f3neas, seg\u00fan cuenta la investigadora.<\/p>\n

<\/a><\/p>\n

Intercambio de datos para una mejor respuesta<\/h3>\n

La Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud (OMS) recomienda una pol\u00edtica de intercambio de datos gen\u00f3micos de pat\u00f3genos para proteger la salud p\u00fablica.<\/p>\n

Espa\u00f1a no tiene una recopilaci\u00f3n central de datos de secuencias de pat\u00f3genos humanos, animales y ambientales, como\u00a0tampoco una pol\u00edtica\u00a0para el intercambio de datos<\/p>\n

Sin embargo, en Espa\u00f1a no existe una recopilaci\u00f3n central de datos de secuencias de pat\u00f3genos humanos, animales y ambientales, como tampoco existe una pol\u00edtica para el intercambio de datos an\u00f3nimos entre entidades de salud y cient\u00edficas.<\/p>\n

Esto dificulta el seguimiento y la respuesta a las enfermedades infecciosas, adem\u00e1s de la resistencia a los antimicrobianos, destacan los cient\u00edficos.<\/p>\n

Referencia:<\/p>\n

Miguel \u00c1lvarez-Herrera. et al.\u00a0Genome data artifacts and functional studies of deletion repair in the BA.1 SARS-CoV-2 spike protein,\u00a0Virus Evolution<\/a>, 2025.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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